庚二、世尊許說（從爾時世尊起是也）。此又分二︰
辛一、普為開示（至開無上乘妙修行路是也）︰一、為回向大乘聲聞、緣覺（二乘極果，但得解脫三界，名曰涅��；未能于菩提心自在，如菩薩上同諸佛慈力，下同眾生悲仰也）；二、為將來大心末法眾生。不徒為阿難，不徒為當時，故曰普為，此蓋結經人所敘佛意也。
辛二、正念審擇（從宣示阿難及諸大眾以去是也）。此又分二︰
壬一、總示修圓通，須先明二決定義（至應當先明發覺初心二決定義是）︰妙三摩地，即圓通也。
壬二、征釋修圓通，雲何為二決定義？此又分二︰
癸一、雙釋（即雲何初心二決定義句）。
癸二、別釋（從阿難第一義者起是也）。此即分二︰
子一、重審因地心，令依全性起修（至皆合涅��清淨妙德是）︰此即是示第一決定義者。先標欲捐舍聲聞，修菩薩乘入佛知見者。聲聞非不修解脫門，其解脫門菩薩亦同修習；然聲聞但依生滅滅生滅，未悟如來藏心妙真如性，故不能依不生滅心為本因地。生滅雖減，不成如來寶覺，正由昧此第一決定義也。故曰︰“若于因地以生滅心為本修因，而求佛乘不生不滅，無有是處”。佛前令阿難悟如來藏者，其效正在乎此。不爛壞虛空，喻妙真如性。本然清潔水、喻如來藏心，所謂湛圓妙覺明心是也。相織妄成五重渾濁，乃依如來藏自證心，幻起見相二分。見為能取，相為所取，二取互縛，不能舍離。此之五濁，大致同乎五陰。濁水、正喻見聞覺知，是生死本，亦涅��本。不隨攀緣取相執性，即是擇去死生根本。水體本清，遍太虛空，即是依不生滅圓湛成性。如澄濁水，貯于靜器（靜器即喻虛空），靜深不動，沙土自沉，清水現前，名為初伏客塵煩惱（此齊二乘所證涅��，亦正修入圓通門相，特彼不知水體清德，但永靜不動耳）︰即是以湛旋其虛妄生滅，伏還元覺，得元明覺無生滅性為因地心（此因地心即圓初住，前所悟本清之水體方現前耳）。去泥純水，名為永斷根本無明，明相精純，一切變現不為煩惱，皆合涅��清淨妙德（此是佛所證涅��、四智菩提、清淨法界也）；即是然後圓成果地修證（即歷住、行、向位至究竟妙覺也）。濁空、清空，空性無異，濁水、清水，水相似異；悟水自體本然清潔，則亦無異，故因地發心與果地覺同。
子二、詳示圓通境，令選一門深入（從第二義者起、至正教當機雙審性修章文盡是也）︰此下阿難重重請問，皆躡此第二決定義而起，正屬觀陰界處煩惱境以湛伏虛妄生滅，得圓明覺之法門也。此即分八︰