黃巢作亂，到了睦州這個地方，城里的人恐嚇萬分，大家只好找和尚了，因為知道他有道。睦州和尚叫他們把自己編的草鞋掛在城門口，結果黃巢的部隊一到，看到四面城門關閉，城上很多天兵天將守衛，黃巢哪信這一套？命令攻城，結果莫名其妙的被打敗了。後來一看城門口有兩只草鞋，才知道陳睦州大法師住在這里，他是個有名的大孝子，于是黃巢退兵而去。不過這段事正史上不記載，認為這太神話了。所以睦州在禪宗里頭是俗僧，就是佛經上所謂長者。
睦州一看到雲門來就關門，理都不理，“師乃扣門。州曰︰誰？師曰︰某甲。州曰︰做什麼？師曰︰己是未明，乞師指示。州開門一見便閉卻。”
這是睦州對雲門的教育法，很有意思的。
“如是連三日扣門。至第三日，州開門，師乃拶入，便擒住曰︰道！道！師擬議，州便推出曰︰秦時(車度)ヾ轢鑽。遂掩門。”
門一開時，雲門的腳便踩進去，睦州也不管，管他是腿也好，手也好，卡噠一聲，雲門的腿被夾傷了。這是禪宗的教育法，真吃不消，現在的人不到法院告他才怪。
“秦時(車度)轢鑽”，就是秦代的老古董，這麼一句話，他悟道了。“損師一足，師從此悟入”，這是雲門的悟緣。
不像靈雲見桃花而悟道，那多舒服啊！還有一個比丘尼，“歸來手把梅花嗅，春在枝頭已十分”，那更是幽雅，雲門可不然，傷了一只腳，總算開悟了。
我們要注意，雖然上面的資料非常簡單，但雲門從小出家，做了十幾年的功夫，律宗的經論、教理都通達了。當然，佛學是佛學，唯識也好，般若也罷，講得再高明也沒有用，此心還是不能安。等到事情來了，用不上，所以己事不明，雲門在追求這個東西。
雲門這一段悟緣的記載比較簡化，如果把他十幾年來的修持經過記下來足為後人作一番參考，可是古人覺得記載自己的事情，有點像自我宣傳，所以不干，今人就不同了。
雲門後來抵靈樹，這是一個江西的廟子。“冥符知聖接首座之記”，這個廟子前任的住持知聖，曾經預言︰將來這里的大方丈，是個得道的人。“初知聖在靈樹二十年，不請首座”，叢林的規矩，和尚下面領頭的叫首座，知聖下面始終未請首座，他的弟子們就問了︰“師父，你請個首座嘛！”知聖說︰“我的首座剛剛出世呢！”過幾年，又說︰“我的首座長大了，現在牧牛。”再過幾年又說︰“我的首座出家了，現在到處行腳參訪。”然後，“喔！悟道了。”有一天，吩咐徒弟們打鐘，大開山門︰“我的首座弟子來了。”大家出來一看，雲門行腳剛到，到這個廟子來掛褡，老和尚一看到人就說︰“奉遲久矣！”我等你很久了。馬上請雲門當首座。過去大叢林請首座，等于現在政府發表院長、部長一樣，極為莊重。